Выпускник Казанской духовной академии. Во время Первой мировой войны – военный священник. В 1919 в сане игумна стал благочинным одного из белых корпусов на Южном Урале, затем принял должность главного священника в армии атамана Дутова. С отступавшими войсками оказался в Китае, где в сентябре 1922 рукоположен в сан епископа Тяньцзиньского, в 1925 году получил титул епископа Ханькоуского. Помог устроиться многим беженцам, основал приют для сирот, открыл аптеку, которая бесплатно раздавала лекарства неимущим. Русские эмигранты очень его любили. Скончался от заражения крови 20 октября 1925 года. В 1996 году Архиерейский Собор Русской Зарубежной Церкви вынес определение о церковном прославлении святителя Ионы Ханькоуского.